by 와 과거완료,단순과거 사용

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질문 내용 :

by June,2006, for example, 63 satellites of Jupiter had been founded
에서요 had been 을 were 로 쓰면 안될까요by June,2006, for example, 63 satellites of Jupiter were founded의미가 달라질 뿐이지 가능하지 않나요?